Sequenziali Protocolli Chip

sequenziale immunoprecipitazione della cromatina , noto come SeqChIP , è un test biologico destinato a definire i modi in cui due proteine ​​interagiscono all'interno di una regione di un acido desossiribonucleico ( DNA) filamento . I ricercatori impegnati una serie specifica di compiti ordinato di rivelare tre possibili relazioni tra proteine ​​sotto valutazione. Come con la maggior parte dei test scientifici , ma esseri con pulizia e termina con la conclusione . Secondo i ricercatori di Harvard , i progressi tecnologici nell'analisi SeqChIP possono consentire agli scienziati di studiare in modo più ampio fenomeni biologici . Preparare

esperimenti SeqChIP contengono un'attenta preparazione per disinfettare e pulire le sfere magnetiche per l'esperimento . I ricercatori devono lavare le perle più volte e pulirle in soluzione " blocco" . Le perle sono poi sospesi per essiccazione e ri - lavati . In generale , gli scienziati lasciare un giorno prima del lavaggio finale prima di procedere alla fase di collegamento . Data la natura dei diversi filamenti di DNA per la valutazione , in questa fase di preparazione varia in complessità . Tuttavia , una verità scientifica rimane: il pulitore della prova , il pulitore il risultato

CrossLink

scienziati selezionare complessi di DNA della proteina, o le aree della ciocca , per il miglioramento . con un anticorpo . In effetti , biologi giustappongono proteine ​​per osservare la loro interazione . Una volta osservato , cross-link deve essere confermato in ordine inverso . Do le proteine ​​ancora si riferiscono quando la sequenza è invertita ? SeqChIP scienziati ritengono che la coesistenza di entrambe le proteine ​​, valutata in senso opposto fornire una prova convincente di completa co - occupazione , e consentire la differenziazione inequivocabile di occupazione parziale e non co -occupazione .

Purify

Polymerase Chain Reaction , o " PCR ", è un processo di amplificazione del DNA che controlla la qualità , o la purezza , di DNA . PCR viene condotta in tre fasi . Primo , PCR scioglie i trefoli parte aumentando la temperatura . Poi , i ricercatori portare i due filoni template tornare insieme con primer PCR . Infine , biologi incubare il DNA in modo che i primer polimerasi inducono le cellule in esame a grappolo . Da lì , i ricercatori si muovono all'esame dei cluster .
Voto

Analysis analizza i filamenti di DNA per la presenza o l'assenza di " occupazione ", un rapporto interattivo tra proteine ​​. Due proteine ​​che associano sempre con lo stesso frammento di DNA hanno completa compresenza; nessun compresenza si verifica quando le proteine ​​possono associare solo in mutuamente esclusive sottopopolazioni di filamento di DNA; parziale compresenza significa che alcune molecole di DNA hanno entrambi proteine ​​, mentre altri hanno uno o l'altro . Se il test SeqChIP è una procedura nel filone della biologia , fornisce agli scienziati la possibilità di applicare i risultati singolari a un'intera struttura genomica .