I protocolli usati in QSAR

QSAR è l'acronimo di relazione quantitativa struttura-attività . Utilizzato per mostrare come una struttura chimica può essere quantitativamente correlato ad uno specifico processo , QSAR è spesso utilizzato per la progettazione di farmaci e droghe . Questa metodologia è utilizzata per guidare la sintesi chimica , in quanto vi sono molte migliaia di diverse strutture possibili per una molecola e gli scienziati potrebbero altrimenti sprecare un sacco di tempo prova di ogni singola struttura . Statistiche svolgono un ruolo importante nella metodologia di QSAR . Regressione lineare multipla

analisi di regressione lineare multipla viene utilizzata quando ci sono diversi studi utilizzati che sono tutti legati ad una struttura chimica specifica. Un'equazione è sviluppato che , per esempio, può mostrare una relazione tra la riduzione delle dimensioni del tumore e la presenza di un gruppo idrofobo sulla quarta posizione di un anello fenilico . Questa analisi si riduce molti composti diversi in modo che la correlazione può essere interpretato utilizzando solo alcuni parametri che sono i più importanti.
Pattern Recognition

riconoscimento pattern viene utilizzato per definire i parametri tale risultato quando le strutture chimiche specifiche sono raggruppati insieme . Ci sono diversi tipi di analisi pattern recognition , che comprendono analisi delle componenti principali , informatico automatizzato valutazione della struttura e l'analisi automatica dei dati mediante tecniche di pattern recognition . Statistiche di pattern recognition utilizzano i dati originali e vi correlare le diverse strutture con i risultati biologici sulla base di diverse dimensioni , con l'essere più significativo del primo componente calcolato .
Comparative Molecular Analisi del Campo

Questa versione di QSAR prende parziale analisi dei minimi quadrati in coppia con la convalida incrociata per creare previsioni per l'attività biologica . In questo tipo di metodologia , lo scienziato assegnerà norme specifiche per l'allineamento della struttura molecolare . Ciascuna delle molecole è in forma in una griglia e poi diverse interazioni sono calcolate in base alle interazioni da un atomo sonda verso le diverse griglie . Ci sono molte equazioni differenti che possono derivare . A differenza di altri tipi di regressione , questo produce equazioni in cui ci sono molti più parametri rispetto a possibili composti
Apex - . 3D

Apex - 3D utilizza un sistema che seleziona automaticamente l'allineamento migliore conformazione e per le strutture basate sulla risposta biologica necessaria da esperimenti precedenti . È possibile scoprire l'effetto dell'orientamento vincolante diversa , attività antagonista contro attività agonista e l'effetto di diversi recettori . Ciò genera matrici topografici 2D e 3D, e può generare informazioni per coppie di molecole , piuttosto che singole molecole .
Funzione genetica Armonizzazione

funzione genetica approssimazione viene utilizzata quando ci sono pochi campioni e diverse variabili oggetto di indagine , e quando i set di dati non hanno relazioni lineari . Questo utilizza i modelli più quotati e modelli peggior rating calcolati dai dati grezzi . Costruisce modelli di qualità sempre migliori sostituendo i modelli peggiori rating. I molti diversi multipli attacchi vengono poi forniti allo scienziato , che poi seleziona il modello finale . Le somiglianze tra i modelli sono studiati per fornire informazioni sulle correlazioni strutturali e biologiche .