Protocolli usati in QSAR

QSAR acronimo di relazione quantitativa struttura-attività. Usato per mostrare come una struttura chimica può essere quantitativamente correlato ad uno specifico processo, QSAR è frequentemente usato per la progettazione di farmaci e droghe. Questa metodologia è utilizzata per guidare la sintesi chimica, in quanto vi sono molte migliaia di diverse strutture possibili per una molecola e gli scienziati potrebbero altrimenti sprecare un sacco di tempo di prova di ogni singola struttura. Le statistiche hanno un ruolo importante nella metodologia di QSAR. Regressione

analisi di regressione multipla lineare multipla lineare è usato quando ci sono diversi studi utilizzati che sono in relazione tra struttura chimica specifica. Un'equazione è sviluppato che, per esempio, può mostrare una relazione tra la riduzione dimensioni del tumore e la presenza di un gruppo idrofobo sulla quarta posizione di un anello fenilico. Questa analisi riduce molti composti diversi in modo che la correlazione può essere interpretato utilizzando solo alcuni parametri che sono i più importanti.
Pattern Recognition
Pattern recognition

viene utilizzato per definire i parametri che si ottengono quando le strutture chimiche specifiche sono raggruppati insieme. Ci sono diversi tipi di analisi di pattern recognition, che comprendono principal component analysis, valutazione struttura automatizzata del computer e l'analisi automatica dei dati con tecniche di pattern recognition. Statistiche di pattern recognition utilizzano i dati originali e saranno correlare le diverse strutture con i risultati biologici sulla base di diverse dimensioni, con l'essere più significativo del primo componente calcolata.
Comparative Molecular Campo Analisi

Questa versione di QSAR prende parziale minimi quadrati in coppia con convalida incrociata per creare le previsioni per l'attività biologica. In questo tipo di metodologia, lo scienziato assegnerà regole specifiche per l'allineamento della struttura molecolare. Ciascuna delle molecole, è adatto in una griglia e poi diverse interazioni sono calcolate sulle interazioni tra un atomo sonda verso le diverse griglie. Ci sono molte equazioni differenti che possono derivare. A differenza di altri tipi di regressione, questo produce equazioni in cui ci sono molto di più parametri rispetto a possibili composti
Apex -. 3D

Apex-3D utilizza un sistema che seleziona automaticamente l'allineamento migliore conformazione e per le strutture basate sulla risposta biologica necessaria da esperimenti precedenti. È possibile scoprire l'effetto di differenti orientamento di rilegatura, attività antagonista contro attività agonista e l'effetto di diversi recettori. Questo genera matrici topografici 2D e 3D e in grado di generare informazioni per coppie di molecole, piuttosto che singole molecole.
Genetica Approssimazione

approssimazione funzione genetica funzione viene utilizzata quando ci sono pochi campioni e le diverse variabili oggetto di indagine, e quando i set di dati non hanno relazioni lineari. Questo utilizza i modelli più quotati e modelli peggior rating calcolati a partire dai dati grezzi. Costruisce modelli migliori e di migliore qualità, sostituendo i modelli peggiori-rated. Le molteplici molteplici accoppiamenti vengono poi forniti allo scienziato, che poi seleziona il modello finale. Le somiglianze tra i modelli sono studiati per fornire informazioni sulle correlazioni strutturali e biologiche.